Zum Inhalt springen

Einladung zu ISAS THINK & TACKLE: Microscopy Machine Vision mit AMBIOM

Dortmund, 25. Mai 2022

Microscopy Machine Vision (MMV) ist einer der Forschungsschwerpunkte der Gruppe AMBIOM –Analysis of Microscopic BIOMedical Images unter der Leitung von Dr. Jianxu Chen am ISAS. Die Forscher:innen und Expert:innen für Künstliche Intelligenz (KI) arbeiten an Algorithmen, um breit angelegte neue Studien zur Entstehung von Erkrankungen und deren Folgen auf der Ebene ganzer Organe und Organsysteme zu ermöglichen. Vom 13. bis 14. Juni 2022, jeweils von 9 bis 17 Uhr, bietet ISAS Think & Tackle biomedizinischen Forscher:innen individuelle Zeit mit den AMBIOM-Expert:innen. Ziel ist es, Herausforderungen bei der Analyse mikroskopischer Bilder anzugehen und das Potenzial von KI zu diskutieren, bevor es an experimentelle Assays geht. Die virtuelle Veranstaltung ist kostenlos.

Wer kann teilnehmen & wie?

Alle biomedizinischen Forscher:innen, die sich mit Ideen oder Herausforderungen bei der Mikroskopie-Bildanalyse befassen möchten, können zwischen "MMV-Brainstorming" (45 Minuten) und "Live-MMV-Hacking" (90 Minuten) wählen. Sie können entweder ein Zeitfenster für sich selbst buchen oder mit ihrem Team teilnehmen.

  1. »MMV-Brainstorming«
    Zeit für eine Diskussion für Forscher:innen, die bereits über ihre Bildgebungsdaten verfügen (oder noch keine Daten haben) und sich mit den Möglichkeiten der KI als Antwort auf eine bestimmte biomedizinische Frage befassen möchten. Ziel ist es, eine maßgeschneiderte Lösung für ihre Herausforderung zu finden.
     

  2. »Live-MMV-Hacking«
    Zeit für Pair Programming für Teilnehmer:innen, die auf technische Hindernisse gestoßen sind oder eine Zweitmeinung zu ihrem vorläufigen Code oder ihrer Methode einholen möchten. Ziel dieser Sitzung ist es, Ideen zu entwickeln, wie sie ihren Code verbessern oder korrigieren können.

Details & Registrierung

Eine Anmeldung ist bis Donnerstag, 9. Juni, möglich. Für die Termine zum Brainstorming oder Hacking gibt es zwei separate Buchungslinks:

  1. »MMV-Brainstorming«: https://calendly.com/ambiom/isas-think-tackle-hacking-session

  2. »Live-MMV-Hacking«: https://calendly.com/ambiom/isas-think-tackle-brainstorming-session

Dr. Jianxu Chen (li.) und seine Mitarbeiter Justin Sonneck und Shuo Zhao stellen bei ISAS Think & Tackle ihre Expertise zur Verfügung.

Dr. Jianxu Chen (li.) und seine Mitarbeiter Justin Sonneck und Shuo Zhao stellen bei ISAS Think & Tackle ihre Expertise zur Verfügung.

© ISAS

Bei Fragen steht jianxu.chen@isas.de zur Verfügung.  

Das Bundesministerium für Bildung und Forschung fördert die MSCoreSys-assoziierte Nachwuchgruppe AMBIOM – Analysis of Microscopic BiOMedical Images unter dem Förderkennzeichen 161L0272.

Teilen

Weitere Beiträge

8. September 2025

3 Fragen an Susmita Ghosh

Wie beeinflusst die Darmflora das Immunsystem? Susmita Ghosh forscht am ISAS zu Proteinen und Immunzellen. Im Interview erzählt die Biologin von ihrer Arbeit und erklärt, wie sich Darmflora und Immunsystem auf die Folgen eines Schlaganfalls auswirken könnten.

Susmita Ghosh sitzt am ultrasensitiven Massenspektrometer und stellt eine Proben ein.
8. September 2025

Darmflora & Schlaganfall – wie Mikroorganismen unser Immunsystem beeinflussen

Welche Faktoren können Immunzellen nach einem Schlaganfall aktivieren? Dieser Frage sind Forschende am Universitätsklinikum Essen und ISAS nachgegangen. Im Fokus ihrer Arbeit stand dabei die Darmmikrobiota.

25. August 2025

PODCAST »NACHGEFORSCHT – DIE LIVESCHALTE INS LABOR« Folge 11: Probenrotor liefert Rundumblick bei Immun- & Gefäßzellen

Mit einem neu entwickelten Workflow, der verschiedene Mikroskopie-Verfahren kombiniert und Proben mithilfe eines Rotors dreht, gelingt es der Forschungsgruppe Bioimaging Zellen in einem gänzlich neuen Umfang sichtbar zu machen. Welche Vorteile dies mit sich bringt, berichtet Dr. Malte Roeßing in der neuen Podcast-Folge.

24. August 2025

Bilder sagen doch nicht mehr als 1.000 Worte

"Die bildgebende Massenspektrometrie den Schritt weg von qualitativen, hübschen Bildern hin zu absolut quantifizierbaren Aussagen schaffen", sagt Prof. Dr. Sven Heiles in seinem Gastbeitrag für ISAS Kompakt. Darin beschreibt er, wieso dies bisher nicht ohne Weiteres möglich war und wie er diese Herausforderung mit seinem Team am ISAS angeht.

Portrait von Jun.-Prof. Dr. Sven Heiles.
12. August 2025

Alles ist relativ: Neue Wege in der bildgebenden Massenspektrometrie

Qualitative und quantitative Daten mithilfe einer einzigen Methode erheben? Das ermöglicht eine Forschergruppe mit ISAS-Beteiligung gleich für eine ganze Substanzklasse und geht so einer vernachlässigten Tropenkrankheit mit weltweit über 200 Mio. Erkrankten auf den Grund.

23. Juli 2025

3 Fragen an Dr. Ali Ata Tuz

In seiner Promotion hat Dr. Ali Ata Tuz zu den Ursachen für Immunschwäche nach Schlaganfällen geforscht und bereits damals eng mit dem ISAS zusammengearbeitet. Auch in der Arbeitsgruppe Bioimaging am ISAS widmete er sich im Anschluss dem Verhalten von Immunzellen. Von seinem Weg von der Klinik in die anwendungsorientierte Grundlagenforschung berichtet der Mediziner im Interview.

Dr. Ali Ata Tuz sitzt am Konfokalmikroskop und schaut frontal in die Kamera.. Auf dem Bildschirm nebem dem Mirkoskop sind in grün und violett Mikroskopaufnahmen von einer Probe im Mikroskop zu sehen.
16. Juli 2025

Erfolgreiche Evaluierung für das ISAS

Eine unabhängige Kommission im Auftrag der Leibniz Gemeinschaft hat die Forschung am ISAS positiv bewertet. Das Ergebnis hat auch einen Einfluss auf die Förderung des Instituts.

Das Foto zeigt eine Frontansicht des Gebäudes am Standort ISAS City. Die Fassade ziert ein Mikroskop.
8. Juli 2025

Herzinsuffizienz tritt selten allein auf: ISAS-Forschende entwickeln neue Therapie-Säulen

Die Symptome, Folgeprobleme und therapeutischen Herausforderungen bei Herzinsuffizienz (Herzschwäche) fordern Hausärzt:innen zunehmend heraus. Vor allem bei Patient:innen mit zusätzlichen Erkrankungen sind Mediziner:innen in der Auswahl an Behandlungsmöglichkeiten limitiert. Am ISAS forschen Wissenschaftler:innen daher daran, das therapeutische Spektrum für die Herzinsuffizienz gezielt zu erweitern.

Prof. Dr. Kristina Lorenz.
25. Juni 2025

Neue Ionisierungsmethode: Von offenen Fragen zum geschlossenen Plasma

Die Massenspektrometrie funktioniert nur mit elektrisch geladenen, also ionisierten Teilchen. Dazu verwenden Forschende häufig ein Plasma. In einer Serie von Veröffentlichungen werfen Wissenschaftler:innen der Forschungsgruppe Miniaturisierung ein nues Licht auf diese Ionisierungsmethode und stellen ein ganz neues Plasma vor. Dieses kommt ohne kontinuierlichen Gasfluss aus und ist damit besonders ressourcensparend.

Cayian Tian justiert die Gaszufuhr am Plasma.