Das ISAS ist mit modernen LC-MS-Systemen ausgestattet, mit denen wir Proteine zuverlässig identifizieren können. Dabei verfolgen wir einen Bottom-Up-Ansatz: Die Proteine werden zunächst enzymatisch verdaut und dann anhand der entstandenen Peptide identifiziert. Mit diesem Ansatz können wir zum Beispiel bereits verarbeitete Proben auf verschiedenen Geräten analysieren; wir übernehmen aber auch die komplette Bearbeitung von Proben, inklusive Zelllyse und Verdau sowie die Proteinbestimmung in einzelnen Gelbanden.