Dr. Jianxu Chen leitet am ISAS die vom Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) geförderte Nachwuchsgruppe AMBIOM – Analysis of Microscopic BIOMedical Images. Seine Forschung dreht sich um biomedizinische Bildanalysen und Deep Learning. Chen ist Experte für die Entwicklung skalierbarer biomedizinischer Bildanalysealgorithmen auf der Grundlage künstlicher Intelligenz (KI), beispielsweise für die Koordination und Auswertung dreidimensionaler Mikroskopie-Aufnahmen. Nach seiner Promotion in Informatik an der University of Notre Dame in Indiana (USA) arbeitete Chen am Allen Institute for Cell Science in Seattle. Dort leitete er die Forschungs- und Entwicklungsarbeiten im Bereich der Mikroskopie-Bildanalyse und die Vorbereitung für die Mikroskopie-Bildanalyse in großem Maßstab für die Produktion. Für die Position als Gruppenleiter am ISAS, zog Chen mit seiner vierköpfigen Familie ins Ruhrgebiet.
Dr. Jianxu Chen
Ausgewählte Publikationen
Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology, Bd. 44, Nr. 4, 2024, S. 915-929
Hagemann N, Qi Y, Mohamud Yusuf A, Li A, Squire A, Tertel T, Giebel B, Ludewig P, Spangenberg P, Chen J, Mosig A, Gunzer M, Hermann DM.
Microvascular Network Remodeling in the Ischemic Mouse Brain Defined by Light Sheet Microscopy
https://doi.org/10.1161/ATVBAHA.123.320339
GigaScience, 2024
Sonneck J, Zhou Y, Chen J.
MMV_Im2Im: an open-source microscopy machine vision toolbox for image-to-image transformation
https://doi.org/10.1093/gigascience/giad120
Nature Methods, Bd. 21, Nr. 3, 2024, S. 368-369
Zhou Y, Cao J, Sonneck J, Banerjee S, Dörr S, Grüneboom A, Lorenz K, Zhang S, Chen J.
EfficientBioAI: making bioimaging AI models efficient in energy and latency
https://doi.org/10.1038/s41592-024-02167-z
Nature Communications, Bd. 14, 2023, S. 1-13
Cibir Z, Hassel J, Sonneck J, Kowitz L, Beer A, Kraus A, Hallekamp G, Rosenkranz M, Raffelberg P, Olfen S, Smilowski K, Burkard R, Helfrich I, Tuz…
ComplexEye:a multi-lens array microscope for high-throughput embedded immune cell migration analysis
https://doi.org/10.1038/s41467-023-43765-3
protocols.io, 2023, S. 1-10
Saw NMMT, Kowitz L, Lampen P, Smith KW, Chen J, Phapale P.
MSI-Explorer - a napari plug-in for biochemical annotation of mass spectrometry imaging data
https://doi.org/10.17504/protocols.io.n2bvj3dyplk5/v1
Nature Machine Intelligence, Bd. 5, 2023, S. 687-698
Jia Z, Chen J, Xu X, Kheir J, Hu J, Xiao H, Peng S, Hu X, Chen D, Shi Y.
The importance of resource awareness in artificial intelligence for healthcare
https://doi.org/10.1038/s42256-023-00670-0
Nature Methods, Bd. 20, 2023, S. 968-970
Chen J, Viana M, Rafelski S.
When seeing is not believing: application-appropriate validation matters for quantitative bioimage analysis
https://doi.org/10.1038/s41592-023-01881-4