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Für eine sichere Identifizierung von Einzelverbindungen in komplexen Gemischen ist die Kopplung der Kapillar-Gaschromatographie mit der Massenspektrometrie, kurz GC/MS, die Methode der Wahl. Voraussetzung für deren Anwendung ist, dass die Analyte verdampfbar und thermisch stabil sind oder sich durch Derivatisierung in flüchtige Verbindungen überführen lassen, wie es für solche mit einem Molekulargewicht bis Masse 1000 meistens gegeben ist. Die bei dieser Methode resultierenden Massenspektren sind bis auf wenige Ausnahmen substanz-spezifisch.